AnyGenes® propose des services de développement de molécules in vitro pour les projets de recherche visant à caractériser la réponse cellulaire à des composés expérimentaux et les modifications moléculaires associées au traitement.
Des essais cellulaires sur des lignées humaines sélectionnées en fonction du projet peuvent être associés à des analyses dose-réponse et à la détermination de l’IC50, puis, lorsque cela est pertinent, à un suivi moléculaire ciblé par qPCR et SignArrays® afin d’explorer les réponses moléculaires et les signatures candidates de biomarqueurs.
Les études de réponse cellulaire à des composés in vitro peuvent être associées à la validation ciblée de biomarqueurs, à l’analyse de la méthylation de l’ADN ou à l’analyse de données moléculaires selon la question biologique et l’avancement du projet.
Caractérisez les réponses à des composés expérimentaux, leurs effets cellulaires et les modifications moléculaires associées à l’aide de modèles cellulaires et d’approches ciblées d’expression génique.
Évaluez des biomarqueurs candidats par qPCR ciblée, avec des SignArrays® centrés sur les voies biologiques ou des panels d’expression génique personnalisés.
Découvrir la validation de biomarqueurs
Examinez la méthylation de l’ADN et la régulation épigénétique par des approches moléculaires ciblées adaptées aux régions génomiques et aux questions biologiques étudiées.
Découvrir l’analyse de la méthylation
Analysez des données génomiques et transcriptomiques à l’aide d’approches statistiques et bioinformatiques adaptées à l’expression génique, aux signatures moléculaires et aux objectifs du projet.
Découvrir l’analyse de données à haut débitAnyGenes® peut réaliser des études de réponse cellulaire à des composés à l’aide de lignées humaines sélectionnées selon la question biologique, la molécule étudiée et l’objectif expérimental.
Selon le projet, le service peut inclure le traitement du modèle cellulaire sélectionné, la mesure de la prolifération ou d’autres réponses fonctionnelles définies, l’analyse dose-réponse et la détermination de l’IC50 lorsque celle-ci est pertinente pour l’essai.
Les conditions expérimentales peuvent ensuite être affinées progressivement afin de sélectionner celles qui seront utilisées pour des analyses moléculaires complémentaires.
Les mesures de réponse cellulaire peuvent servir à définir les conditions les plus pertinentes pour un suivi moléculaire ciblé.
Contexte de recherche : les réponses observées dans un modèle in vitro apportent des données expérimentales obtenues dans des conditions biologiques définies. Elles ne permettent pas, à elles seules, d’établir une efficacité clinique, une sécurité clinique ou une réponse thérapeutique individuelle.
AnyGenes dispose d’une collection de lignées cellulaires humaines pouvant être sélectionnées en fonction de leur pertinence biologique, de leur disponibilité et des besoins du projet.
Les essais de prolifération cellulaire et d’autres tests fonctionnels sélectionnés peuvent caractériser les effets associés au composé et comparer des conditions expérimentales définies.
Plusieurs concentrations peuvent être testées afin de caractériser les effets dépendants de la dose et, lorsque cela est approprié, d’estimer l’IC50 dans le modèle cellulaire sélectionné.
Dans les essais standards de réponse cellulaire, les conditions expérimentales sont réalisées en triplicat avec des contrôles appropriés.
Interprétation de l’IC50 : une valeur d’IC50 dépend du modèle cellulaire, du paramètre mesuré, de la durée d’exposition et des conditions expérimentales. Elle doit donc être interprétée dans le contexte de l’étude considérée.
Les expériences dose-réponse et les valeurs d’IC50 peuvent contribuer à définir des concentrations et des conditions de traitement pertinentes pour des analyses moléculaires complémentaires.
Les données dose-réponse peuvent guider le choix des concentrations du composé et des temps d’exposition pour les analyses moléculaires suivantes, en tenant compte de la question biologique et de la réponse cellulaire observée.
Les échantillons issus de conditions expérimentales sélectionnées peuvent être analysés par PCR quantitative en temps réel et à l’aide de SignArrays® ciblant des voies de signalisation et des processus biologiques définis.
La comparaison de conditions expérimentales définies peut mettre en évidence des profils d’expression associés au traitement, des signatures moléculaires et des biomarqueurs candidats à approfondir.
Interprétation mécanistique : l’association des réponses cellulaires, de l’expression génique ciblée et de l’analyse des voies biologiques peut contribuer à explorer les mécanismes moléculaires associés au traitement. Ces données ne permettent pas, à elles seules, d’établir un mécanisme d’action complet ni de prédire une réponse clinique.
Selon le périmètre du projet, AnyGenes peut coordonner le processus expérimental depuis le traitement cellulaire et la préparation des échantillons jusqu’à l’analyse moléculaire ciblée et l’interprétation des données.
Le projet peut relier la question biologique, la mesure de la réponse cellulaire et le suivi moléculaire ciblé au sein d’une même stratégie expérimentale.
Préciser le composé, la question biologique, le modèle cellulaire et les comparaisons expérimentales.
Sélectionner les concentrations, les temps d’exposition, les contrôles et la stratégie de réplication.
Caractériser la prolifération ou d’autres réponses fonctionnelles sélectionnées et générer les données dose-réponse.
Utiliser les données de réponse cellulaire et l’IC50, lorsqu’elle est pertinente, pour définir les analyses complémentaires.
Examiner les gènes, voies biologiques et signatures moléculaires associées au traitement par des approches ciblées.
Conception modulable du projet : toutes les études ne nécessitent pas ces cinq étapes. Un projet peut démarrer à partir d’un composé expérimental, de données de réponse existantes, de conditions de traitement déjà définies ou d’échantillons nécessitant un suivi moléculaire.
Le point de départ dépend de l’avancement de votre projet et des données expérimentales déjà disponibles.
Une ou plusieurs molécules à évaluer dans un modèle cellulaire approprié peuvent constituer le point de départ du projet.
Un objectif de recherche défini et, lorsqu’il est déjà identifié, un modèle cellulaire pertinent peuvent guider la stratégie expérimentale.
Des données préliminaires de prolifération, de dose-réponse, d’IC50 ou d’autres résultats expérimentaux peuvent servir de base aux étapes suivantes.
Des cibles moléculaires déjà identifiées, des voies biologiques sélectionnées ou des échantillons issus de conditions de traitement définies peuvent être intégrés à un suivi qPCR ciblé.
Une étude publiée dans une revue à comité de lecture illustre l’intégration de technologies AnyGenes® d’expression génique ciblée dans l’étude de la réponse à un traitement et de l’acquisition de résistance.
Une étude portant sur le passage d’une réponse précoce au méthotrexate à un phénotype résistant dans des cellules HT29 de cancer colorectal a intégré un profilage ciblé des lncRNA à l’aide du Human LncRNA and Cancer SignArray® d’AnyGenes.
Technologies AnyGenes® utilisées : Human LncRNA and Cancer SignArray® · StaRT Reverse Transcription Kit · logiciel d’analyse SignArray®
Réponses aux questions courantes sur les études de réponse cellulaire, la détermination de l’IC50 et le suivi moléculaire ciblé.
Ces services utilisent des modèles cellulaires expérimentaux pour caractériser la réponse des cellules à des composés ou à des conditions de traitement définies. Selon le projet, les mesures de réponse cellulaire peuvent être complétées par une analyse moléculaire ciblée afin d’examiner les modifications d’expression génique associées au traitement.
Oui. La détermination de l’IC50 peut être intégrée à des expériences dose-réponse adaptées au modèle cellulaire sélectionné. La gamme de concentrations, la durée d’exposition et le paramètre mesuré sont définis selon le composé et l’objectif de recherche.
Oui. Les SignArrays® sont des panels qPCR ciblés sur des voies de signalisation et des processus biologiques sélectionnés. Ils peuvent notamment être utilisés pour comparer les réponses transcriptionnelles entre des conditions expérimentales définies.
Les analyses cellulaires et moléculaires ciblées peuvent contribuer à explorer les mécanismes biologiques associés à une réponse expérimentale. Les résultats doivent cependant être interprétés dans les limites du modèle utilisé et ne permettent pas, à eux seuls, d’établir un mécanisme d’action complet ni une réponse clinique.
AnyGenes® dispose d’une collection de lignées cellulaires humaines pour les études in vitro. Le choix du modèle dépend de sa pertinence biologique, de sa disponibilité et des besoins du projet.
Présentez-nous votre molécule, votre question biologique, le modèle cellulaire envisagé, vos conditions de traitement ou vos données expérimentales existantes. Notre équipe scientifique pourra discuter avec vous d’une stratégie cellulaire adaptée et déterminer si un suivi moléculaire ciblé peut compléter votre étude.
