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L’analyse microbiote qPCR avec les solutions AnyGenes® permet de soutenir le profilage ciblé du microbiome par PCR en temps réel, grâce à des couples d’amorces évalués expérimentalement et à des formats flexibles pour la détection de souches microbiennes et l’étude du microbiote.
Disponibles sous forme de primers individuels ou de Microbiota SignArrays® personnalisables, ces solutions permettent d’analyser des espèces ou souches microbiennes sélectionnées, de comparer des groupes d’échantillons et de construire des panels qPCR adaptés à vos objectifs de recherche.
Les assays microbiote AnyGenes® sont conçus pour l’analyse qPCR ciblée d’espèces ou de souches microbiennes sélectionnées, avec des formats adaptés aux cibles individuelles comme aux panels microbiote personnalisés.
Analysez des espèces ou souches microbiennes sélectionnées par qPCR selon une question de recherche microbiote définie.
Les couples d’amorces microbiote sont évalués sur des collections d’ADN microbien et par contrôles qualité qPCR.
Après validation qPCR, des amplicons sélectionnés peuvent être séquencés afin de soutenir l’évaluation de la spécificité.
Choisissez des assays microbiote individuels ou construisez des Microbiota SignArrays® personnalisés au format 96 ou 384 puits.
Des contrôles peuvent être intégrés pour suivre la performance des assays, la qualité des échantillons et les risques de contamination ADN.
Les assays sont conçus pour être utilisés avec le Perfect Master Mix SYBR® Green AnyGenes® et des instruments qPCR compatibles.
L’analyse microbiote qPCR permet d’étudier des espèces, souches ou panels microbiens sélectionnés. Contrairement aux approches exploratoires larges, la qPCR ciblée se concentre sur des cibles microbiennes définies, en lien avec une question biologique précise.
Les assays microbiote qPCR AnyGenes® peuvent être utilisés pour suivre des signatures microbiennes entre groupes d’échantillons, valider des observations issues d’analyses microbiome ou construire des panels personnalisés pour des études ciblées.
Choisissez des espèces, souches, sites corporels ou thématiques biologiques selon votre objectif de recherche.
Utilisez des assays individuels ou des Microbiota SignArrays® personnalisables au format 96 ou 384 puits.
Réalisez une analyse qPCR ciblée avec les réactifs, contrôles et outils d’interprétation adaptés.
AnyGenes® propose plusieurs formats qPCR pour accompagner les projets allant de la détection de cibles microbiennes individuelles aux panels microbiote personnalisés.
Assays qPCR individuels pour des espèces ou souches microbiennes sélectionnées, adaptés à la détection ciblée ou à la validation de cibles microbiote spécifiques.
Format panel qPCR 96 puits personnalisable pour le profilage ciblé du microbiote à travers une sélection de cibles microbiennes.
Format panel qPCR 384 puits personnalisable pour les études microbiote ciblées de plus grande taille ou les projets à plus haut débit.
AnyGenes® a développé une base de données microbiote à partir de souches microbiennes et de publications scientifiques afin d’aider les chercheurs à sélectionner des cibles pertinentes pour leurs assays microbiote qPCR et Microbiota SignArrays® personnalisés.
Les cibles peuvent être recherchées par espèce hôte, niveau taxonomique ou organes afin de construire un panel adapté au modèle expérimental et à la question de recherche microbiote.
Sélectionnez des cibles pertinentes pour les échantillons humains ou les modèles de laboratoire comme la souris ou le rat.
Explorez les cibles par phylum, classe, ordre, famille, genre ou espèce, selon votre projet.
Construisez des panels pour des études ciblées sur le microbiote intestinal, oral, cutané ou d’autres contextes biologiques.
Les assays microbiote qPCR peuvent accompagner des études ciblées en recherche microbiome, interactions hôte-microbe et projets orientés biomarqueurs.
Analyser des espèces, souches ou signatures microbiennes sélectionnées dans les études du microbiote intestinal.
Soutenir l’analyse qPCR ciblée de cibles microbiennes dans des échantillons associés à la peau.
Étudier des espèces microbiennes sélectionnées dans des échantillons de cavité orale ou de microbiote salivaire.
Explorer des signatures microbiote sélectionnées dans des projets liés à la régulation immunitaire, l’inflammation ou la réponse de l’hôte.
Soutenir des analyses microbiote ciblées dans des projets explorant les environnements tumoraux, tissulaires ou associés au microbiome.
Construire des panels ciblés autour de cibles microbiennes impliquées dans la résistance aux antibiotiques ou l’écologie microbienne.
Les assays microbiote qPCR nécessitent une attention particulière au design des amorces, à la sélection des cibles microbiennes et aux contrôles expérimentaux afin de soutenir la spécificité et l’interprétation des résultats.
Les assays microbiote prêts à l’emploi AnyGenes® sont évalués à l’aide de collections d’ADN microbien et de contrôles qualité qPCR. Le séquençage d’amplicons peut être utilisé après validation qPCR afin de soutenir l’évaluation de la spécificité pour certaines cibles microbiennes.
Les assays sont conçus pour cibler des espèces ou souches microbiennes sélectionnées tout en limitant les risques d’amplification non spécifique.
La performance qPCR peut être évaluée à travers le comportement d’amplification, les contrôles et des étapes de validation adaptées à l’assay.
Les contrôles aident à suivre la performance des assays, la qualité des échantillons et les risques de contamination ADN.
Les assays microbiote AnyGenes® sont disponibles sous forme de primers individuels ou de panels SignArrays® personnalisables. Contactez AnyGenes® pour obtenir un devis, des informations de compatibilité ou un accompagnement dans le design de votre panel.
| Reference type : MB–XXXX–100 | |
| Primers individuels pour le Microbiote | |
| Nombre de réactions | Prix (HT) |
|---|---|
*XXXX = nom de l’espèce microbienne (selon la nomenclature approuvée par NCBI Taxonomy)
* nombre de réactions
* MB pour Microbiote
Example: ME-B.vulgatus.8482-100 pour un lot de primers spécifiques de l’espèce Bacteroides vulgatus ATCC 8482 pour 100 réactions
| Reference type : PZxHMB1-Y2S | |
| Personnalisable | |
| Nombre de SignArrays® 96 | Prix/unité (HT) |
|---|---|
* Y: Type de plaque R, A, B ou F, selon l’instrument de qPCR
*2: selon le nombre de SignArrays® Microbiote commandés
example: PZxHMB1-R12S pour 12 SignArrays® 96 Microbiote pour l’instrument Light Cycler® 480
NB: Le nombre minimal de plaques personnalisées commandées sont de 4 pour moins de 32 gènes différents par plaque ou de 6 pour plus de 32 gènes différents par plaque.
| Reference type : PZxHMB2-Y2S | |
| Personnalisable | |
| Nombre de SignArrays® 384 | Prix/unité (HT) |
|---|---|
* Y: R, A, B or F plate type, according to the qPCR instrument
*2: according to the number of ordered Microbiota SignArrays®
example: PZxHMB2-R12S for 12 Microbiota SignArrays® 384 for Light Cycler® 480 instrument
** Please request for an estimate at: [email protected]
NB: The minimum order for customizable plates are 2 for less than 32 different species/plate or 6 for more than 32 different species/plate.
Les assays microbiote AnyGenes® sont conçus pour être utilisés avec des réactifs Perfect Master Mix SYBR® Green compatibles, selon le format d’analyse, le volume réactionnel et l’instrument qPCR.
Les réactifs Perfect Master Mix SYBR® Green peuvent être associés aux assays microbiote individuels selon les formats de réaction sélectionnés.
Les réactifs PMS associés peuvent être sélectionnés selon le format SignArrays® 96 et l’instrument qPCR compatible.
Des réactifs PMS sont disponibles pour les workflows microbiote 384 puits et les volumes réactionnels adaptés.
| Reference type : PMS1-Z100 | |
| Perfect Master Mix SYBR® Green reagent (PMS) | |
| Nombre de réactions | Prix (HT) |
|---|---|
* 10 μl de PMS par réaction pour un volume final de 20µl
* Z: PMS de type W, R, LR ou F, selon l’instrument de qPCR
* nombre de réactions
Example: PMS1-W100 pour du Perfect Master Mix SYBR® Green pour 100 réactions compatible avec l’instrument Light Cycler® 480
| Reference type : PMS1-Z2S | |
| PMS Perfect Master Mix SYBR® Green SignArrays® 96* | |
| Number of SignArrays® 96 | Prix/unité (HT) |
|---|---|
* 10 μl de PMS par réaction pour un volume final de 20µl
* Z: PMS de type W, R, LR ou F, selon l’instrument de qPCR
*2:selon le nombre de SignArray® 96 Microbiote commandés
example: PMS1-W12S pour l’analyse de 12 SignArrays® 96 Microbiote pour l’instrument Light Cycler® 480
| Reference type : PMS2-Z2S | |
| PMS (Perfect Master Mix SYBR® Green) SignArrays® 384* | |
| Nombre de SignArrays® 384 | Prix/unité (HT) |
|---|---|
* 5 μl de PMS par réaction pour un volume final de 10µl
* Z: PMS de type W, R, LR ou F, selon l’instrument de qPCR
*2: selon le nombre de SignArray® 384 Microbiote commandés
** Pour tout devis, veuillez nous contacter à: [email protected]
example: PMS2-W12S pour 12 SignArrays® 384 Microbiote pour l’instrument Light Cycler® 480
AnyGenes® peut vous aider à sélectionner les cibles microbiennes, choisir le format d’analyse adapté et construire un workflow qPCR microbiote selon votre type d’échantillon, l’espèce hôte, le site biologique et votre objectif de recherche.
Que votre projet concerne le microbiote intestinal, cutané, oral, l’immunité, l’inflammation, la recherche en cancérologie ou la résistance aux antibiotiques, notre équipe peut vous aider à définir une stratégie qPCR ciblée.
Les assays microbiote qPCR servent à détecter et quantifier des espèces ou souches microbiennes sélectionnées dans des workflows ciblés de profilage du microbiome.
Les assays microbiote qPCR ciblent des cibles microbiennes sélectionnées, tandis que les approches 16S s’appuient sur des régions bactériennes conservées pour un profilage taxonomique plus large. La qPCR ciblée est utile lorsque des espèces ou souches spécifiques doivent être suivies.
Oui. AnyGenes® peut préparer des Microbiota SignArrays® personnalisés à partir de cibles microbiennes sélectionnées, de l’espèce hôte, du site biologique ou de l’objectif de recherche.
Les workflows microbiote qPCR peuvent être adaptés à différents échantillons, comme le microbiote intestinal, cutané, oral ou d’autres contextes biologiques, selon la qualité de l’ADN et la stratégie d’extraction.
Oui. Les Microbiota SignArrays® peuvent être préparés en formats 96 ou 384 puits selon le nombre de cibles, l’instrument qPCR compatible et les besoins du projet.
Oui. AnyGenes® peut aider à sélectionner les cibles microbiennes et à concevoir un panel qPCR selon l’espèce hôte, le site biologique, la question scientifique et l’objectif de recherche microbiote.
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