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AnyGenes

Kit de préamplification qPCR pour échantillons à faible quantité d’ARN

Le kit de préamplification qPCR SpeAmp® AnyGenes® est conçu pour soutenir la préamplification ciblée du cDNA avant PCR en temps réel, analyse par qPCR arrays et profilage de l’expression génique orienté voies de signalisation.

Ce workflow est particulièrement utile lorsque la quantité d’ARN est limitée, lorsque les cibles sont faiblement exprimées ou lorsque le matériel biologique est difficile à obtenir, notamment pour les échantillons single-cell, les ARN issus d’échantillons FFPE, les échantillons obtenus par microdissection laser et les populations cellulaires rares.

Faible quantité d’ARN Préamplification cDNA Compatible SignArrays® Validation RNA-seq
Kit de préamplification qPCR SpeAmp AnyGenes pour faible quantité d’ARN single-cell FFPE et qPCR arrays

Kit de préamplification qPCR SpeAmp® : points clés

SpeAmp® soutient la préamplification ciblée de cibles cDNA sélectionnées avant analyse qPCR, afin d’accompagner les projets impliquant de faibles quantités d’ARN ou des gènes faiblement exprimés.

À partir de faibles quantités d’ARN

Conçu pour les workflows utilisant une quantité limitée d’ARN, avec des applications possibles à partir de 5 ng d’ARN selon la qualité de l’échantillon et le design expérimental.

Préamplification ciblée du cDNA

Amplifie des cibles cDNA sélectionnées avant qPCR, sans recourir à une amplification transcriptomique globale.

Analyse orientée voies

Peut accompagner l’analyse de panels SignArrays® sélectionnés et de signatures d’expression génique orientées biomarqueurs.

Jusqu’à 368 gènes

Soutient des panels ciblés de grande taille, notamment des workflows couvrant jusqu’à 368 gènes.

Jusqu’à 4 voies de signalisation

Peut être utilisé pour le profilage de jusqu’à 4 voies de signalisation dans des workflows SignArrays® adaptés.

Échantillons exigeants

Adapté aux projets impliquant ARN faible input, FFPE, LCM, PBMC, cellules rares, single-cell et validation RNA-seq.

Comment la préamplification qPCR accompagne l’analyse faible input

Les expériences transcriptomiques à faible input peuvent générer des signaux d’amplification faibles, une variabilité accrue des Cq et une détection moins robuste des transcrits peu abondants. Ces difficultés sont fréquentes avec les cellules rares, les échantillons single-cell, les ARN issus de FFPE, les petites biopsies ou les échantillons obtenus par microdissection laser.

SpeAmp® soutient la préamplification qPCR en augmentant la quantité de cibles cDNA sélectionnées avant l’analyse par PCR en temps réel, tout en conservant une approche ciblée sur des gènes, des voies de signalisation ou des panels biomarqueurs définis.

1. Transcription inverse

L’ARN est converti en cDNA à l’aide d’un workflow de transcription inverse adapté au type d’échantillon.

2. Préamplification spécifique

Les cibles cDNA sélectionnées sont préamplifiées avec SpeAmp® et des pools d’amorces appropriés.

3. Analyse qPCR ou qPCR arrays

Le cDNA préamplifié est analysé avec des essais qPCR, des panels SignArrays® ou des workflows ciblés d’expression génique.

Les performances de préamplification dépendent de la qualité de l’ARN, de l’abondance des cibles, de l’efficacité de transcription inverse, du design des pools d’amorces, du type d’échantillon et des conditions qPCR en aval.

Performance validée de la préamplification cDNA

SpeAmp® a été développé par AnyGenes® pour soutenir une préamplification cDNA reproductible avant analyse par qPCR arrays.

Forte corrélation après préamplification

SpeAmpn reagents are validated to ensure very high correlation between experiments performed with and without cDNA Preamplification.
qPCR arrays results obtained after SpeAmpn cDNA Preamplification step are more reliable and easily interpretable, especially for low expressed genes.
Des expériences de validation ont montré une forte corrélation entre les échantillons préamplifiés et non préamplifiés, soutenant l’interprétation des résultats dans les workflows ciblés d’expression génique. Résultats clés de validation
  • Forte corrélation entre expériences
  • Profils d’expression conservés après préamplification
  • Amplification fiable des gènes faiblement exprimés
  • Validation sur ARN humain et murin
Point de validation : R² > 0,99 dans des expériences de validation sélectionnées.

Amplification reproductible entre expériences

preamplification cDNA: SpeAmpn reagents have been optimised to give you reproducible qPCR results.
Des expériences indépendantes ont confirmé une amplification hautement reproductible pour les analyses qPCR orientées voies biologiques et les workflows transcriptomiques à faible input ARN.
Point de validation : évalué dans plus de 20 expériences indépendantes.

Compatible avec les panels SignArrays® et les amorces groupées Primnx

SpeAmp® peut être combiné avec les panels SignArrays® AnyGenes®, le Perfect Master Mix SYBR® Green et les systèmes d’amorces groupées Primnx afin de construire des workflows de préamplification qPCR ciblés.

Panels SignArrays®

Soutient les workflows qPCR arrays orientés voies de signalisation, processus biologiques et panels biomarqueurs sélectionnés.

Amorces groupées Primnx

Les pools d’amorces peuvent être adaptés à des gènes sélectionnés, des panels SignArrays®, des signatures transcriptomiques personnalisées ou des voies biologiques spécifiques.

Perfect Master Mix SYBR® Green

Peut être utilisé dans des workflows PCR en temps réel compatibles avec la chimie SYBR® Green pour l’analyse d’expression génique en aval.

Applications du kit de préamplification qPCR SpeAmp®

SpeAmp® est conçu pour les projets de biologie moléculaire où l’abondance des cibles, la quantité d’ARN ou la disponibilité de l’échantillon limitent l’analyse qPCR directe.

Expression génique single-cell

Soutient l’analyse qPCR ciblée lorsque le projet implique des cellules individuelles ou une quantité très limitée de matériel cellulaire.

Expériences à faible quantité d’ARN

Aide à augmenter la quantité de cibles cDNA sélectionnées avant qPCR lorsque l’ARN disponible est limité.

ARN issu d’échantillons FFPE

Peut accompagner les workflows qPCR impliquant des ARN fragmentés ou difficiles provenant d’échantillons archivés.

Échantillons LCM et petites biopsies

Utile pour les projets impliquant la microdissection laser ou des quantités limitées de tissu.

Validation RNA-seq

Soutient la validation ciblée par qPCR de résultats RNA-seq sélectionnés lorsque le matériel de départ est limité.

Profilage de voies et biomarqueurs

Peut être combiné avec les panels SignArrays® pour analyser des voies sélectionnées ou des signatures biomarqueurs.

Réactifs inclus dans le système SpeAmp®

Le système SpeAmp® comprend des réactifs destinés à la préamplification ciblée du cDNA et peut être combiné avec des pools d’amorces optionnels selon le workflow qPCR sélectionné.

Perfect Master Mix

Mélange d’amplification contenant une ADN polymérase Taq thermostable, un tampon d’amplification, du MgCl₂ et des dNTPs pour la préamplification cDNA.

AmpPuren

Système de purification enzymatique conçu pour nettoyer les produits de préamplification avant l’analyse qPCR en aval.

Amorces groupées Primnx

Pools d’amorces optionnels correspondant à des panels SignArrays® sélectionnés, des signatures géniques personnalisées ou des voies biologiques spécifiques.

Catalogue du kit de préamplification qPCR

Les kits SpeAmp® et les amorces groupées Primnx sont disponibles en différents formats de réaction. Contactez AnyGenes® pour obtenir un devis, des informations produit ou les coordonnées de votre distributeur.

Prix des kits de PreAmplification SpeAmp®

Référence
catalogue
Nombre
de réactions
Prix (HT)
SpeAmp® – 1010***
SpeAmp® – 2525***
SpeAmp® – 5050***

XXXX : code de la voie de signalisation sélectionnée

example : AN1H pour l’angiogénèse 1 pour l’espèce Homo sapiens

Prix des pools de primers Primnx associés

Référence
catalogue
Nombre
de réactions
Prix (HT)
Primnx-10 XXXX10***
Primnx-25 XXXX25***
Primnx-50 XXXX50***

SpeAmp® peut être intégré avec d’autres solutions qPCR AnyGenes® afin de soutenir les projets single-cell, faible input et profilage d’expression génique orienté voies.

Analyse à cellule unique

Combinez lyse directe, préamplification et panels SignArrays® pour des workflows qPCR ciblés en cellule unique.

Réactifs de lyse directe

Utilisez DiLysis™ pour accompagner les workflows de lyse directe impliquant des cellules rares ou du matériel biologique limité.

Amorces qPCR validées

Utilisez des couples d’amorces validés pour l’analyse qPCR ciblée de gènes et biomarqueurs sélectionnés.

Besoin d’aide pour un projet qPCR à faible input ?

AnyGenes® peut vous aider à définir la stratégie de préamplification qPCR la plus adaptée à votre type d’échantillon, votre quantité d’ARN, vos gènes cibles, votre panel SignArrays® et votre analyse en aval.

Que votre projet implique l’analyse à cellule unique, l’ARN issu d’échantillons FFPE, les échantillons LCM, la validation RNA-seq, le profilage des lncRNA ou la qPCR orientée voies, notre équipe peut vous aider à construire un workflow ciblé.

Questions fréquentes sur les kits de préamplification qPCR

Qu’est-ce qu’un kit de préamplification qPCR ?

Un kit de préamplification qPCR amplifie des cibles cDNA sélectionnées avant l’analyse PCR en temps réel afin de soutenir la détection de transcrits peu abondants ou les workflows utilisant une quantité limitée d’ARN.

Quand utiliser un Kit de préamplification qPCR ?

La préamplification qPCR est utile lorsque la quantité d’ARN est limitée, lorsque les gènes cibles sont faiblement exprimés ou lorsque les échantillons sont difficiles à obtenir, comme les échantillons single-cell, FFPE, LCM, cellules rares ou petites biopsies.

SpeAmp® Kit de préamplification qPCR est-il compatible avec les panels SignArrays® ?

Oui. SpeAmp® peut être combiné avec les panels SignArrays® AnyGenes® et les amorces groupées Primnx pour des workflows de préamplification qPCR orientés voies de signalisation.

Quelle quantité d’ARN est nécessaire pour les workflows SpeAmp® ?

SpeAmp® peut accompagner des workflows utilisant une quantité limitée d’ARN, notamment des applications à partir de 5 ng d’ARN, selon la qualité de l’échantillon, l’abondance des cibles et le design expérimental.

SpeAmp® peut-il être utilisé pour la validation RNA-seq ?

Oui. SpeAmp® peut soutenir la validation ciblée par qPCR de résultats RNA-seq sélectionnés, en particulier lorsque le matériel ARN restant est limité.

Le workflow de préamplification peut-il être personnalisé ?

Oui. Les amorces groupées Primnx peuvent être adaptées à des gènes sélectionnés, des panels biomarqueurs, des voies de signalisation ou des signatures transcriptomiques personnalisées.

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