AnyGenes propose des services de recherche sur les biomarqueurs pour les projets nécessitant une analyse moléculaire ciblée, l’étude de l’expression génique, des approches expérimentales de réponse aux composés, l’analyse de la méthylation de l’ADN ou l’interprétation de données moléculaires à haut débit.
Notre équipe scientifique peut vous aider à définir une stratégie adaptée à votre question de recherche, aux échantillons ou données disponibles, aux cibles candidates et à vos objectifs expérimentaux.
Des modèles expérimentaux et biomarqueurs candidats jusqu’à l’analyse moléculaire ciblée et l’interprétation des données.
Les approches peuvent être sélectionnées en fonction de votre question de recherche, du matériel biologique disponible et des données déjà obtenues.
Échangez avec notre équipe scientifique sur vos échantillons, gènes candidats, données moléculaires ou objectifs expérimentaux.
Les projets axés sur les biomarqueurs peuvent nécessiter des approches expérimentales et analytiques différentes. Identifiez le service AnyGenes correspondant le mieux à votre question de recherche, depuis l’étude de réponses cellulaires à des composés jusqu’à la validation de candidats, l’épigénétique ou l’interprétation de données moléculaires.
Caractérisez les réponses expérimentales à des composés, leurs effets cellulaires et les modifications moléculaires associées à l’aide de modèles cellulaires et d’approches ciblées d’expression génique.
Découvrir les études in vitro
Évaluez des biomarqueurs candidats par qPCR ciblée, à l’aide des SignArrays® centrés sur les voies biologiques ou de panels d’expression génique personnalisés selon les objectifs du projet.
Découvrir la validation de biomarqueurs
Examinez la méthylation de l’ADN et les mécanismes de régulation épigénétique grâce à des approches moléculaires ciblées adaptées aux régions génomiques et aux questions biologiques étudiées.
Découvrir l’analyse de la méthylation de l’ADN
Explorez des jeux de données génomiques et transcriptomiques à l’aide d’approches statistiques et bioinformatiques adaptées à l’expression génique, aux signatures moléculaires et aux objectifs de l’étude.
Découvrir l’analyse de données à haut débitAnyGenes peut associer des modèles expérimentaux in vitro à des analyses moléculaires ciblées afin d’explorer les réponses biologiques liées à un traitement expérimental, les mécanismes d’action et les signatures candidates de biomarqueurs.
Selon la question étudiée, un projet peut intégrer des modèles cellulaires de réponse aux composés, l’analyse ciblée de l’expression génique, le profilage de voies biologiques et l’analyse des données.
Contexte de recherche: ces approches sont destinées à la recherche expérimentale et translationnelle. Les profils de réponse moléculaire ou signatures candidates de biomarqueurs identifiés dans des modèles de recherche ne permettent pas, à eux seuls, d’établir une efficacité clinique, une utilité clinique ou une réponse thérapeutique individuelle.
AnyGenes s’appuie sur sa propre plateforme de laboratoire en biologie moléculaire ainsi que sur des capacités dédiées en analyse de données afin d’accompagner des projets de recherche sur les biomarqueurs, depuis le matériel expérimental jusqu’à l’interprétation des données moléculaires. Les approches peuvent être adaptées à la question biologique, aux échantillons disponibles, aux cibles moléculaires et aux données déjà acquises.
La plateforme de laboratoire AnyGenes permet d’intégrer différentes approches moléculaires en fonction des besoins du projet :
Des workflows analytiques dédiés peuvent contribuer à l’interprétation de données génomiques et transcriptomiques et à l’identification de profils moléculaires ou de cibles candidates à approfondir. Ils peuvent notamment intégrer :
Approche adaptée au projet : la combinaison des technologies de laboratoire et des méthodes analytiques dépend de l’objectif scientifique, du matériel biologique disponible et des données déjà acquises. Tous les projets de biomarqueurs ne nécessitent pas l’ensemble de ces technologies.
Un projet de recherche sur les biomarqueurs peut commencer à partir de matériel biologique, d’acides nucléiques extraits, de cibles moléculaires candidates ou de jeux de données existants. Le workflow approprié dépend des caractéristiques des échantillons, de la quantité de matériel disponible et de la question scientifique.
Les échantillons issus de tissus peuvent être envisagés pour des analyses moléculaires selon leur état, la quantité disponible et les exigences de la méthode sélectionnée.
Les modèles cellulaires peuvent être utilisés pour des études de réponse aux traitements expérimentaux, d’expression génique ou d’exploration ciblée de voies moléculaires.
Les cellules mononucléées du sang périphérique (PBMC) peuvent être intégrées à des workflows moléculaires adaptés à la question biologique et au plan expérimental.
Les tissus fixés au formol et inclus en paraffine (FFPE) peuvent être envisagés pour certaines analyses moléculaires compatibles, en tenant compte de la qualité et de la quantité des acides nucléiques ainsi que des exigences de l’essai.
Le projet peut débuter directement à partir d’ARN ou d’ADN déjà extrait lorsqu’il est disponible pour les analyses moléculaires en aval.
Des données génomiques ou transcriptomiques peuvent constituer le point de départ d’une analyse statistique, d’une priorisation de candidats et d’un suivi moléculaire ciblé.
Une sélection préalable de gènes, transcrits, voies biologiques ou signatures moléculaires peut servir de base à une investigation ou à une validation ciblée.
Un projet peut également démarrer à partir de composés, de conditions de traitement ou d’observations préliminaires nécessitant une caractérisation moléculaire complémentaire.
Adéquation des échantillons : la compatibilité avec un workflow donné dépend de la nature, de la qualité et de la quantité du matériel biologique. Ces paramètres doivent être examinés avant de définir la stratégie expérimentale.
La question de recherche détermine quelles capacités de laboratoire et d’analyse de données peuvent être associées à des approches plus ciblées pour l’étude de candidats, l’épigénétique ou l’analyse de l’expression génique.
Profilez des gènes sélectionnés, des voies de signalisation ou des signatures transcriptionnelles à l’aide d’essais qPCR individuels, de SignArrays® prêts à l’emploi ou de panels personnalisés.
Étudiez des profils de méthylation sélectionnés et des modifications épigénétiques dans le cadre de questions moléculaires ou biologiques définies.
Appliquez des méthodes statistiques et bioinformatiques adaptées au projet à des données génomiques ou transcriptomiques afin d’identifier des profils, des gènes candidats ou des signatures moléculaires.
Les approches moléculaires et les stratégies axées sur les biomarqueurs peuvent accompagner différents domaines de recherche. Le choix de la méthode dépend du modèle expérimental, des données disponibles et de l’objectif scientifique.
Caractérisez les modifications moléculaires associées à la biologie tumorale, à l’exposition à un traitement, à la prolifération, à la mort cellulaire ou à des signatures transcriptionnelles liées à la maladie.
Explorez les médiateurs inflammatoires, les réponses liées aux cytokines, les voies associées à l’immunité et certaines signatures moléculaires.
Étudiez les réponses moléculaires associées à des modèles vasculaires, endothéliaux, cardiaques ou pulmonaires.
Caractérisez les modifications d’expression génique et les réponses moléculaires associées à la neuro-inflammation, au stress oxydatif ou à la survie cellulaire.
Explorez les modifications moléculaires associées à la méthylation et certains mécanismes épigénétiques dans le cadre de questions biologiques ou pathologiques définies.
Comparez les réponses cellulaires et moléculaires entre différentes conditions de traitement à l’aide d’approches in vitro adaptées au projet.
Le niveau d’accompagnement peut varier selon le service et le projet, depuis la réception de matériel biologique ou de données moléculaires jusqu’à l’analyse ciblée, au traitement des données et à leur interprétation biologique.
Examiner la question de recherche, le matériel disponible, les cibles moléculaires et les comparaisons prévues.
Démarrer à partir de matériel biologique, d’acides nucléiques extraits ou d’un jeu de données moléculaires existant, selon le projet.
Mettre en œuvre l’approche expérimentale sélectionnée en fonction de la question biologique et des exigences du projet.
Traiter et structurer les données expérimentales ou à haut débit à l’aide de méthodes analytiques adaptées au plan d’étude.
Comparer les conditions expérimentales, examiner les profils moléculaires et replacer les résultats dans le contexte de la question de recherche.
Accompagnement modulable : tous les projets ne nécessitent pas ces cinq étapes. L’intervention d’AnyGenes peut être adaptée au matériel, aux données et aux analyses déjà disponibles au démarrage du projet.
Des technologies AnyGenes ont été intégrées à des workflows de recherche indépendants publiés dans des revues à comité de lecture, notamment en transcriptomique, biologie du cancer, recherche cardiovasculaire et pulmonaire et études orientées biomarqueurs.
Des résultats transcriptomiques sélectionnés dans le contexte du syndrome de Cornelia de Lange ont été étudiés à l’aide de panels qPCR personnalisés AnyGenes.
Technologie :
Panels qPCR personnalisés d’expression génique
Un profilage ciblé des lncRNA a été intégré à une étude portant sur la réponse et la résistance au méthotrexate dans des cellules de cancer colorectal.
Technologie :
Human LncRNA and Cancer SignArray® · StaRT · logiciel d’analyse
Une approche qPCR centrée sur les voies biologiques a été utilisée pour étudier l’expression génique associée à la dysfonction endothéliale dans l’hypertension artérielle pulmonaire.
Technologie :
Endothelial Dysfunction SignArray® · StaRT · Perfect Master Mix
Réponses aux questions courantes pour identifier le service moléculaire ou l’approche de recherche AnyGenes adaptée à votre projet.
AnyGenes propose des services complémentaires couvrant les études in vitro de réponse aux composés, l’identification et la validation ciblée de biomarqueurs, l’analyse de la méthylation de l’ADN et l’analyse de données moléculaires à haut débit. Le service le plus adapté dépend de la question de recherche ainsi que du type de matériel ou de données déjà disponibles.
Oui. Selon le projet, des biomarqueurs candidats peuvent d’abord être identifiés ou priorisés à partir de données expérimentales, de données transcriptomiques, de l’analyse de voies biologiques ou de la littérature scientifique, puis être étudiés par des approches ciblées telles que la qPCR ou des panels d’expression génique personnalisés.
Oui. Des données génomiques ou transcriptomiques existantes peuvent constituer un point de départ pour la priorisation de candidats, l’analyse statistique et un suivi moléculaire ciblé. La stratégie suivante dépend du jeu de données, de l’objectif scientifique et des candidats sélectionnés.
Oui. Des SignArrays® personnalisés peuvent être conçus autour de gènes sélectionnés, de voies de signalisation, d’une espèce et d’objectifs de recherche définis. Ces panels peuvent être utilisés pour des études ciblées de biomarqueurs ou pour approfondir certains résultats issus d’analyses transcriptomiques.
Le choix dépend avant tout de votre point de départ. Un projet peut commencer avec un composé expérimental, des échantillons biologiques, une liste de gènes candidats, des cibles de méthylation ou un jeu de données moléculaires.
Présentez-nous votre question de recherche, les échantillons disponibles, vos gènes candidats, vos composés expérimentaux ou votre jeu de données moléculaires. Notre équipe scientifique pourra discuter avec vous d’une stratégie expérimentale ou analytique adaptée aux objectifs de votre projet.
